婦人科で原因がわからないと言われるということは、子宮内膜症や卵巣のう腫などの婦人科的な病気のために生じている痛みではないようですね。
性交痛で受診され、実際に何か異常がある方はむしろ少数のようです。
自分の膣がせまいために、性交時痛があると感じて受診された場合でも、男性器よりは明らかに大きいと思われる診察器具がやすやすと挿入できる方が多いです。

性交時に痛みがあるということをちゃんと相手に伝えておられますか？いつか慣れるはず・・・と我慢されていると、余計に緊張が強くなって悪循環を起こすこともあります。相手に悪いと感じておられるようですが、痛みの原因が相手にあることも十分考えられます。男性にとっては挿入後が重要なようですが、女性にとっては挿入までの準備段階が非常に重要です。その準備段階をすっとばして、あせって、膣の周りの緊張がほぐれておらず、膣内の潤いも十分でない状態で挿入すると、女性が痛みを感じやすいのです。
口にするのはとても難しいことだとは思いますが、相手の方とちゃんと話し合ってみてください。